Departemen Teknik Pertanian dan Biosistem mempunyai lima laboraorium sebagai unit pengembangan bidang ilmu Teknik Pertanian yaitu :

1. Laboratorium Energi dan Mesin Pertanian (EMP)
2. Laboratorium Teknik Pangan dan Pascapanen (TPP)
3. Laboratorium Teknik Sumberdaya Lahan dan Air (TSLA)
4. Laboratorium Teknik Lingkungan dan Bangunan Pertanian (TLBP)
5. Laboratorium Fisika Hayati (Biofisik)